Sơ lược cốt truyện

Cốt truyện xoay quanh một cậu học sinh cấp 3 tên là Kamijou Touma, cậu ta sở hữu cánh tay phải có năng lực có thể vô hiệu hoá bất kì siêu năng lực hay phép thuật nào dù mạnh đến đâu khi anh chạm vào. Đồng thời, năng lực này cũng gây cho anh chàng này khá nhiều phiền phức.

Nhân vật chính

-Kamijou Touma (Năng lực: Imagine Breaker), nhân vật chính của bộ truyện. Cậu là một Level 0 ở Thành Phố Học Viện và là một học sinh năm nhất cao trung. Nếu các nhân vật khác thường là trời sinh ra đã xui xẻo thì Touma lại là kẻ tự vác đá đập chân mình. Cậu có một năng lực bí ẩn gọi là Imagine Breaker ở cánh tay phải có thể vô hiệu hóa bất kì năng lực siêu nhiên nào, kể cả sức mạnh của Chúa. Nó thậm chí còn vô hiệu hóa cả vận may của cậu. Không chỉ vậy, năng lực kì lạ của Touma còn khiến bạn bè ganh ghét, khiến Touma trở thành "cục thịt dư" của xã hội. Gặp xui đã đành, giờ còn có một đám cười hí ha hí hố khi mình xui xẻo thử hỏi còn gì cay hơn nữa chứ? Nếu phải gánh chịu cuộc sống như Touma để đổi lấy năng lực kia thì thôi xin kiếu. Tuổi thơ của Touma là một chuỗi dài bất hạnh vì năng lực dễ gây hiểu lầm của mình. Mọi người đều đổ lỗi cho cậu vì sự xui xẻo của mình mỗi khi cậu đến gần. Cha của Touma cuối cùng cũng gửi cậu đến Academy City (Thành phố Học Viện) để cho cậu một khởi đầu mới và đưa cậu ra khỏi những con người độc ác và mê tín luôn tìm cách hãm hại cậu trong suốt tuổi thơ. Mọi chuyện hẳn cũng không quá tệ nếu Touma chọn làm một khách qua đường thờ ơ nhưng cậu lại có niềm tin mãnh liệt vào công lý và luôn sẵn lòng giúp đỡ mọi người, dù có phải mạo hiểm cả mạng sống của mình, và cũng không do dự khi đấu với đối thủ mạnh hơn mình nhiều lần. Thế là vô hình chung, Touma liền trở thành một cột thu xui xẻo di động, suốt ngày va vấp đủ thứ tai họa từ trên trời rơi xuống. Mọi điều càng rắc rối thêm khi cậu dính vào một nhân vật có tên là Index và cô Railgun Misaka Mikoto. Có lẽ để đền bù cho số kiếp hẩm hiu ấy, Touma lại có năng lực khiến mọi cô gái quan tâm đến cậu, không phải vì cậu quá đẹp trai hay tài giỏi, mà bởi… trông cậu quá tội nghiệp. Cuối Index Arc, cậu bị ảnh hưởng bởi cánh lông vũ ánh sáng của đòn Dragon Breath khiến các tế bào não bị đốt cháy làm cậu bị mất trí nhớ. Dù vậy, cậu vẫn không muốn nói cho Index biết mình bị mất trí nhớ vì không muốn làm cô buồn. Trong suốt bộ truyện, chỉ có vài người mới biết được việc cậu bị mất trí nhớ. Cậu là một trong ba người làm ảnh hưởng đến kế hoạch của Aleister nhiều nhất. Không ai có thể nói Kamijou Toma đẹp trai bởi quả đầu lông nhím lúc nào cũng rối bù, trông chẳng khác gì mấy tên lưu manh đầu đường xó chợ. Tuy kiểu tóc làm mất đi vẻ đẹp trai, nhưng lúc chiến đấu, Kamijou Toma lại tỏa ra một sự cuốn hút kì lạ. Dù ở trong nghịch cảnh như thế nào, Kamijou Toma quyết không bỏ cuộc mà sẽ kiên trì đến cùng. Chính tinh thần không bao giờ khuất phục trước khó khăn này của cậu đã làm fan mê như điếu đổ.

-Index Librorum Prohibitorum (Khả năng: Spell Intercept), thường gọi là Index, là nhân vật nữ chính của bộ truyện và là người của phe Phép thuật. Cô là thành viên của Necessarius, pháp hiệu là Dedicatus545, và có bộ nhớ hoàn hảo làm cô không thể quên bất cứ thứ gì cô từng nhìn qua. Cô nắm giữ 103,000 cuốn sách phép ở trong đầu của mình và có thể trở thành một Majin nếu có mana. Cô rất tốt bụng và luôn đối xử lịch sự với người khác. Dù vậy, cô luôn đối xử như trẻ con khi liên quan đến Touma. Cô thường cắn vào đầu Touma mỗi khi cậu ta chọc giận mình hay làm gì ngu ngốc. cuối Index Arc, cô bắt đầu có tình cảm với Touma và thậm chí là tỏ tình với cậu khi nghe tin cậu bị mất trí nhớ. Dù vậy, vì không muốn làm cô buồn nên Touma đã giả như đó chỉ là một trò đùa.

-Misaka Mikoto (Năng lực: Railgun), là nhân vật nữ chính thứ hai của bộ truyện, sở hữu năng lực điện. Cô xếp hạng ba Level 5 ở Thành Phố Học Viện với biệt danh là Railgun. Touma thường gọi cô là Biri Biri mỗi khi gặp mặt, kể cả sau khi cậu bị mất trí nhớ. Cô là học sinh năm hai trường trung học Tokiwadai và được gọi là Át chủ bài của trường. Với hầu hết mọi người, cô được xem là một oujo-sama hay là công chúa điện nhưng trong thực tế, cô rất nóng tính, kiêu ngạo, thường thể hiện tính cách tomboy và thiếu tự tin trước một số người. Dù vậy, cô vẫn đối xử thân thiện và phóng khoáng với một số người bạn của mình. Misaka có mái tóc nâu ngắn trông rất là cá tính cùng với tính cách lạnh lùng, có phần hơi trẻ con một chút được rất nhiều người yêu thích. Cô đã giải quyết biết bao vụ rắc rối, rất nhiều lần nguy hiểm tới tính mạng nhưng cô không bận tâm. Cô từng là một Level 1 nhưng nhờ chăm chỉ, cô đã đạt tới vị trí thứ ba của Level 5. Cô cũng có lòng tin lẽ phải mạnh mẽ khi hạ gục những tên côn đồ gây chuyện, hay giúp đỡ Judgement. DNA của cô đã được phân tích và nhân bản thành các Sister dùng trong thí nghiêm 'Chuyển đổi Level 6'  dành cho Accelerator. Và chương trình đó đã bị sụp đổ sau khi Accelerator bị Touma đánh bại. Sau đó, cô bắt đầu có cảm tình với Touma nhưng lại không biết cảm xúc đó là gì cả.

-Accelerator (Năng lực: Accelerator), là nhân vật chính thứ hai của bộ truyện và là người của phe Khoa học. Anh ta là siêu năng lực gia mạnh nhất Thành Phố Học Viện với năng lực 'Thay đổi véc tơ'. Anh từng là nhân vật phản diện khi là người tham gia vào thí nghiệm 'Chuyển đổi Level 6'. Nhưng từ khi bị Kamijou Touma đánh bại, anh dần chuyển qua làm người tốt và ra sức bảo vệ Last Order, nhân bản Sister 20.001. Sau này anh gia nhập 'Mặt tối' của Thành Phố Học Viện và trở thành thành viên của GROUP vì nghe đó là cách tốt nhất để bảo vệ Last Order. Anh cũng là một trong ba người làm ảnh hưởng đến kế hoạch của Aleister nhiều nhất.

-Hamazura Shiage (Năng lực: Không), là nhân vật chính thứ ba của bộ truyện, thuộc phe Khoa học. Anh là một Level 0 và là cựu thành viên của Skill-Out đến khi bị đánh bại bởi Kamijou Touma. Sau này, anh gia nhập 'Mặt tối' của Thành Phố Học Viện và trở thành thành viên của ITEM. Anh là một 'người bình thường' có thể làm được những 'chuyện bình thường' mà các siêu năng lực gia thường không làm được. Anh có người yêu là Takitsubo Rikou, và cố gắng bảo vệ người ấy dù có dùng thủ đoạn thế nào đi nữa. Anh là người làm ảnh hưởng nhiều nhất đến kế hoạch của Aleister.